Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prph2P15499 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prph2P15499 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms