Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calb1P12658 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Calb1P12658 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms