Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms