Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LtaP09225 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtaP09225 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LtaP09225 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LtaP09225 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LtaP09225 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtaP09225 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms