Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06323 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06323 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P06323 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06323 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06323 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06323 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P06323 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P06323 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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