Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JunP05627 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JunP05627 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JunP05627 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JunP05627 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JunP05627 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JunP05627 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms