Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tk1P04184 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tk1P04184 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms