Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01808 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01808 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01808 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01808 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01808 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01808 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01808 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01808 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01808 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms