Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01672 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01672 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01672 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01672 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01672 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01672 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01672 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01672 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01672 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01672 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01672 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01672 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms