Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01635 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01635 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01635 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01635 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01635 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01635 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01635 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms