Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casp8O89110 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casp8O89110 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms