Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hcn2O88703 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms