Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmx1bO88609 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lmx1bO88609 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmx1bO88609 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms