Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nme6O88425 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme6O88425 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms