Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag3O70576 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag3O70576 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag3O70576 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag3O70576 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag3O70576 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag3O70576 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stag3O70576 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stag3O70576 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stag3O70576 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms