Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nptx2O70340 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nptx2O70340 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms