Protein–RNA interactions for Protein: O70194

Eif3d, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3dO70194 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3dO70194 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3dO70194 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3dO70194 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif3dO70194 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3dO70194 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms