Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
FiglaO55208 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FiglaO55208 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms