Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb2O55203 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb2O55203 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms