Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1bO55017 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms