Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ppfibp2O35711 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppfibp2O35711 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms