Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold2O35654 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pold2O35654 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pold2O35654 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms