Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npc1O35604 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npc1O35604 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npc1O35604 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms