Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc1a6O35544 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc1a6O35544 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms