Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh2d1bO35324 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms