Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmd4O35226 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms