Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps1O08983 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hps1O08983 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps1O08983 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hps1O08983 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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