Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eftud2O08810 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms