Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckarO08786 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckarO08786 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CckarO08786 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckarO08786 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckarO08786 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckarO08786 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CckarO08786 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CckarO08786 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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