Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
U90926O08546 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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U90926O08546 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
U90926O08546 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
U90926O08546 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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