Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm2056J3QQ02 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm2056J3QQ02 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms