Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BC024978J3QPC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BC024978J3QPC3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms