Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisa8J3QNX5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa8J3QNX5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms