Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn34c2J3QNM1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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