Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21244J3QK38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms