Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20828J3KMI7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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