Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pot1bH7BX60 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pot1bH7BX60 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms