Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn20G5E8X0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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