Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ercc6F8VPZ5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ercc6F8VPZ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms