Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc37F8VPK0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc37F8VPK0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms