Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm20538F6Z9R1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms