Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
2610001J05RikF2Z3Y9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms