Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c2bE9QAN8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c2bE9QAN8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms