Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lmod3E9QA62 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lmod3E9QA62 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms