Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2237E9Q501 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2237E9Q501 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms