Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApobE9Q414 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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