Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5430401F13RikE9Q328 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5430401F13RikE9Q328 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms