Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
6430550D23RikE9Q1X6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
6430550D23RikE9Q1X6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms