Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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NebE9Q1W3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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NebE9Q1W3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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