Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdr1E9Q0B4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdr1E9Q0B4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms